La instancia, que agotó cupos en tan solo minutos, busca entregar conocimiento sobre métodos de secuenciación genómica y habilidades bioinformáticas, para analizar conjuntos de datos genómicos grandes y complejos, y es respaldada por tres Centros ANID y dos universidades.
Santiago, viernes 28 julio 2023.- Manejar sistema operativo LINUX a través de líneas de comando en terminal, verificar la calidad de genomas completos, o ensamblar genomas a partir de genomas de referencia, son parte de los objetivos del primer “Taller Bioinformática básica: Y sus aplicaciones en el ensamblaje de genomas de especies no modelo”, que se desarrollará del 31 de julio al 3 de agosto de 2023, de forma presencial, en la Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas Universidad de Chile (FCFM). Av. Beauchef 851, Santiago, Región Metropolitana.
El programa contempla trabajos prácticos y la utilización de sistema operativo Linux, para que las y los estudiantes puedan desarrollarán destrezas en el manejo de data science con énfasis en datos de genomas completos. A su vez, se realizarán trabajos prácticos a lo largo de los módulos.
Debido al éxito de la convocatoria, que completó cupos en tan solo minutos, y registró más de 80 participantes, la comisión académica evalúa una nueva versión, orientada a módulos de nivel intermedio y avanzados con análisis genómicos comunes en revistas de alto impacto. La instancia, además contará con los destacados académicos Dra. María José Frugone y Dr. Boris Rebolledo como profesores invitados.
El “Taller Bioinformática básica: Y sus aplicaciones en el ensamblaje de genomas de especies no modelo”, se desarrollará del 31 de julio al 3 de agosto de 2023, y es respaldado por la Sociedad de Genética de Chile (SOCHIGEN), la Pontificia Universidad Católica de Chile, la Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas (FCFM) de la Universidad de Chile, el Centro de Regulación del Genoma (CRG), el Núcleo Milenio del Límite de Vida Patagónico (LiLi) y el Instituto Milenio Biodiversidad de Ecosistemas Antárticos y Subantárticos, conocido también como Instituto Milenio BASE; tres centros de investigación científica de excelencia, pertenecientes a la Iniciativa Científica Milenio de la Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo de Chile (ANID).
Acerca de los profesores
DRA. FABIOLA LEÓN
Investigadora Postdoctoral. Pontificia Universidad Católica de Chile, Instituto Milenio BASE
Instituto Milenio CRG
MSC. EDUARDO PIZARRO G.
Asistente de Investigación en Pontificia Universidad Católica de Chile, Instituto Milenio
BASE e Instituto Milenio CRG
DRA. JULIANA A. VIANNA
Profesora de la Pontificia Universidad Católica de Chile, Instituto Milenio BASE e Instituto Milenio CRG, también de Instituto para el Desarrollo Sustentable UC y Núcleo Milenio LiLi
Acerca de los ayudantes
ING. FORESTAL ELISA GONZÁLEZ
Estudiante de Magíster en Recursos Naturales Pontificia Universidad Católica de Chile, y Núcleo Milenio LiLi
ESTUDIANTE FÍSICA FABIÁN RODRÍGUEZ
Estudiante de Física en la Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas (FCFM) de la Universidad de Chile
El programa sinóptico contempla aspectos como la Introducción a la genómica, bioinformática, Conexión y transferencias con Máquinas Remotas, Datos de secuencias genómicas, Remoción de adaptadores, index y barcodes (Trimmomatic, Fastp) y Formatos de alineación: SAM y BAM, entre otros.
Por Marcelo Sotomayor y Nadia Politis
Afiche: Instituto Milenio BASE
